nature20121220-1

由英国伦敦帝国学院,荷兰格罗宁根大学等处领导的,超过100个研究机构,包括英,美,荷兰,法,德,爱沙尼亚等研究人员在内的一个研究团队公布了血红细胞形成的最新遗传位点,采用的技术是全基因组关联研究方法,分析了135367个体基因组,找到了七十五个直接影响红细胞不同性状的遗传区域。

-2012年12月20日《自然》


中文翻译


【题目】影响人类血红细胞的75个遗传位点

【译文】贫血是世界人口不健康的主要决定因素之一,会导致认知缺陷、生长迟缓以及体质受损。为了进一步了解影响血红细胞的遗传因素,本研究在135367例个体中展开了血红蛋白和相关参数之间的全基因组范围关联研究。本研究在P<10−8 的水平上鉴定出了75个与一种或更多种血红细胞表型相关的独立遗传位点,这些位点联合起来可以解释每个性状4-9%的表型变异性。利用表达数量性状遗传位点和生物信息学策略,我们鉴定出121个候选基因,这些基因功能与血红细胞生物学相关。候选基因优先在血红细胞前体中表达,43个候选基因在小鼠和果蝇中具有造血表型。通过开放染色质和编码突变体分析,我们在41个位点上鉴定出了潜在原因性遗传突变体。我们的发现为了解控制血红细胞形成和功能的遗传机制和生物学通路提供了新的视角。

英文原稿


[Title]: Seventy-five genetic loci influencing the human red blood cell

[Authors]: Pim van der Harst,1, 2, 129 Weihua Zhang,3, 4, 129 Irene Mateo Leach,1, 129Augusto Rendon,5, 6, 7, 8, 129 Joban Sehmi,4, 9, 129 Dirk S. Paul,10, 129 Ulrich Elling,11, 129 Bruce H. R. Wolffenbuttel,126 Dorret I. Boomsma,30 Nicole Soranzo10, 129 & John C. Chambers3, 4, 14, 128, 129 et al.

[Abstract]Anaemia is a chief determinant of global ill health, contributing to cognitive impairment, growth retardation and impaired physical capacity. To understand further the genetic factors influencing red blood cells, we carried out a genome-wide association study of haemoglobin concentration and related parameters in up to 135,367 individuals. Here we identify 75 independent genetic loci associated with one or more red blood cell phenotypes at P<10−8, which together explain 4–9% of the phenotypic variance per trait. Using expression quantitative trait loci and bioinformatic strategies, we identify 121 candidate genes enriched in functions relevant to red blood cell biology. The candidate genes are expressed preferentially in red blood cell precursors, and 43 have haematopoietic phenotypes in Mus musculus or Drosophila melanogaster. Through open-chromatin and coding-variant analyses we identify potential causal genetic variants at 41 loci. Our findings provide extensive new insights into genetic mechanisms and biological pathways controlling red blood cell formation and function.

原文地址

http://www.nature.com/nature/journal/v492/n7429/full/nature11677.html

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