science20121221-1

来自加拿大多伦多大学、葡萄牙里斯本大学等单位组成的国际研究小组对大量脊椎动物(包括青蛙、鸡、灵长类和人类)的信使RNA进行了高通量测序,结果发现mRNA剪接的模式和复杂性取决于物种差异而不是器官差异。

-2012年12月21日《科学》

中文翻译


【题目】脊椎动物选择性剪接的进化蓝图

【译文】很多物种具有相同性质的蛋白编码基因,但这些基因的表型却相差极大,其中原因尚且不清楚。通过比较来自进化时间跨度约为300,000,000年的几种脊椎动物的器官转录组,本研究发现在不同的脊椎动物中,它们选择性剪接的复杂性存在显著差异,其中灵长类动物的选择性剪接最复杂。6百万年内,生理功能相等的器官的转录剪接谱发生分歧,因此细胞内发生的剪接与物种的类别显著相关,与它们所处的器官无关。大多数脊椎动物的特异性剪接模式是顺式作用元件决定的。然而,一部分显著的剪接变化被认为是由于反式作用因子参与的蛋白质互作方式发生改变。这些发现可能有助于进一步揭示脊椎动物表型差异的原因——剪接的多样性和其他的转录组修饰作用。

英文原稿


[Title]: The Evolutionary Landscape of Alternative Splicing in Vertebrate Species

[Authors]: Nuno L. Barbosa-Morais, Manuel Irimia, Qun Pan, Hui Y. Xiong, Serge Gueroussov, Leo J. Lee, Valentina Slobodeniuc, Claudia Kutter, Stephen Watt, Recep Çolak, TaeHyung Kim, Christine M. Misquitta-Ali, Michael D. Wilson, Philip M. Kim, Duncan T. Odom, Brendan J. Frey, and Benjamin J. Blencowe

[Abstract]: How species with similar repertoires of protein-coding genes differ so markedly at the phenotypic level is poorly understood. By comparing organ transcriptomes from vertebrate species spanning ~350 million years of evolution, we observed significant differences in alternative splicing complexity between vertebrate lineages, with the highest complexity in primates. Within 6 million years, the splicing profiles of physiologically equivalent organs diverged such that they are more strongly related to the identity of a species than they are to organ type. Most vertebrate species-specific splicing patterns are cis-directed. However, a subset of pronounced splicing changes are predicted to remodel protein interactions involving trans-acting regulators. These events likely further contributed to the diversification of splicing and other transcriptomic changes that underlie phenotypic differences among vertebrate species.

原文地址

http://www.sciencemag.org/content/338/6114/1587.abstract

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