来自美国加州大学旧金山分校霍华休斯医学研究中心的研究人员对人类巨细胞病毒进行了解码,发现了数以百计的、先前未鉴定到开放阅读框。这项工作为研究巨细胞病毒的蛋白组及其时序调节提供了基础框架。

-2012年11月23日《科学》

中文翻译


【题目】解码人类巨细胞病毒

【译文】人类巨细胞病毒(HCMV)的基因组在20年前已完成测序。然而,像其他复杂的病毒一样,我们对其蛋白编码潜能理解的完整性是远远不够的。我们借助核糖体组图谱和转录本分析,使用实验确定HCMV的翻译产物并分析了它们的时间表达规律。我们鉴定到数以百计的先前未鉴定到开放阅读框,并借助质谱分析法证实了其中的一部分开放阅读框。我们发现可替代的转录起始位点的使用规范具有广泛的作用,它既能严格控制HCMV蛋白的表达时间,又能允许单一基因组位点转录出不同的多肽。我们的结果表明HCMV的蛋白编码能力远远比我们的想象还要复杂,同时说明了转录起始位点的使用变化对于这种蛋白编码复杂性的产生具有一定的作用。

英文原稿


[Title]: Decoding Human Cytomegalovirus

[Authors]:Noam Stern-Ginossar, Ben Weisburd, Annette Michalski, Vu Thuy Khanh Le, Marco Y. Hein, Sheng-Xiong Huang, Ming Ma, Ben Shen, Shu-Bing Qian, Hartmut Hengel, Matthias Mann, Nicholas T. Ingolia, and Jonathan S. Weissman

[Abstract]: The human cytomegalovirus (HCMV) genome was sequenced 20 years ago. However, like those of other complex viruses, our understanding of its protein coding potential is far from complete. We used ribosome profiling and transcript analysis to experimentally define the HCMV translation products and follow their temporal expression. We identified hundreds of previously unidentified open reading frames and confirmed a fraction by means of mass spectrometry. We found that regulated use of alternative transcript start sites plays a broad role in enabling tight temporal control of HCMV protein expression and allowing multiple distinct polypeptides to be generated from a single genomic locus. Our results reveal an unanticipated complexity to the HCMV coding capacity and illustrate the role of regulated changes in transcript start sites in generating this complexity.

原文地址

http://www.sciencemag.org/content/338/6110/1088.short

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