science20121214-5

来自奥地利科学院分子医学研究中心的研究人员发现一个长非编码的RNA(lncRNA)能够通过转录干扰沉默它的靶定基因簇基因。这项研究揭示了一类新型的基因沉默机制。

-2012年12月14日《科学》

中文翻译


【题目】Airn基因发生转录重叠进而转录诱导沉默印记基因Igf2r

【译文】哺乳动物中编码长非编码(lnc)RNAs的印记基因常常簇集在一块。三种lncRNAs能够诱导亲代基因特异性的基因沉默,说明它们的转录产物比翻译产物更重要的这一特点。为了验证是Airn基因的转录产物还是翻译产物沉默Igf2r基因,我们将内源的lncRNA截断成不同长度的若干片段。结果排除了剪接和非剪接的Airn基因的lncRNA及Airn基因核大小和定位对Igf2r基因沉默的作用。反之,在缺少抑制性染色质时,仅需Airn基因的转录重叠(覆盖Igf2r基因的启动子区域)就能沉默Igf2r基因,这是因为干扰了RNA聚合酶II招募到Igf2r基因的启动子上。考虑到细胞内存在大量的lncRNA,以及lncRNA的转录重叠具有的抑制作用,本研究认为这种基因沉默机制可能广泛地存在于哺乳动物基因组中。

英文原稿


[Title]: Airn Transcriptional Overlap, But Not Its lncRNA Products, Induces Imprinted Igf2r Silencing   

[Authors]: Paulina A. Latos, Florian M. Pauler, Martha V. Koerner, H. Başak Şenergin, Quanah J. Hudson, Roman R. Stocsits, Wolfgang Allhoff, Stefan H. Stricker, Ruth M. Klement, Katarzyna E. Warczok, Karin Aumayr, Pawel Pasierbek, and Denise P. Barlow

[Abstract]: Mammalian imprinted genes often cluster with long noncoding (lnc) RNAs. Three lncRNAs that induce parental-specific silencing show hallmarks indicating that their transcription is more important than their product. To test whether Airn transcription or product silences the Igf2r gene, we shortened the endogenous lncRNA to different lengths. The results excluded a role for spliced and unspliced Airn lncRNA products and for Airn nuclear size and location in silencing Igf2r. Instead, silencing only required Airn transcriptional overlap of the Igf2r promoter, which interferes with RNA polymerase II recruitment in the absence of repressive chromatin. Such a repressor function for lncRNA transcriptional overlap reveals a gene silencing mechanism that may be widespread in the mammalian genome, given the abundance of lncRNA transcripts.

原文地址

http://www.sciencemag.org/content/338/6113/1469.abstract

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